1.生理学。ホルモン、酵素、特異的なタンパク質（例：腫瘍マーカ）などのマーカとされる物質が血液または組織の中に異常な量で存在する場合、疾病の存在を示している可能性がある。また、特定の細胞タイプに対し特異性を持つ分子（例：CD抗原）もマーカとなる。そのようなマーカは、特定の細胞の識別や最終的には単離に使用される。
2.遺伝学。「標識遺伝子」を参照。
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